Aderiscono a Transpadana Confindustrie regionali e territoriali, Camere di commercio locali e Unioncamere regionali, alcuni enti locali (Regioni, Province, Città Metropolitane), Autorità Portuali e istituti di credito delle Regioni del Nord Italia attraversate dai corridoi ferroviari europei. Sono inoltre associate organizzazioni straniere con fini statutari assimiliabili: Transalpine, Ferrmed, Central European Initiative.